nii格式和mat格式转化（只针对功能磁共振成像）
最新推荐文章于 2024-03-14 21:39:42 发布
我的Coder小屋
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mat格式与nii格式的ROI转化
- 问题描述：
- 具体方法：
- nii转mat
- mat转nii
问题描述：
我是在对壳核分割的时候出现的这个问题，因为我要用分割出来的壳核或者是从wfupickatlas中定义的ROI来和自己设置的ROI来进行combine取交集。这时就出现了一个问题，前面定义的出来的格式是nii格式的，而用MarsBar定义的ROI是mat格式的，并且MarsBar只能识别mat格式的roi。于是上网查两者的格式如何转化，也有好多方法来实现互相转化，这里就不说了，因为并没有解决我的这个问题，我将nii转换为mat后MarsBar并不能识别。困惑了好久，才发现MarsBar本身就可以实现。。。。（有点尴尬）
具体方法：
方法其实很简单，MarsBar界面有个ROI definition，这个选项下面就有Import/Export两个按钮（之前一直没管过是干什么的，以后还是得多注意），直接演示吧。
nii转mat
因为MarsBar是mat格式的，因此选择Import导入按钮来进行转化：
点击Import，如下：
选择cluster image，点击：
然后，选择nii格式的图片，done
选择输出路径，然后Done，如下：
其他的默认就行
之后就转化成功了，如下，这里之所以是两个mat是因为Putamen是经过左右合并后的：
之后就可以选择view来查看了：
mat转nii
这里使用Export选项，操作如下：
点击cluster image，如下：
选择mat文件，done，如下：
选择输出文件：
文件名设置如下，回车即可。
nii结果如下：
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到【灌水乐园】发言
是指猴子: 前壳核这个位置，最后根据前后脑的分界线，将壳核一分为二了
看了很多文章，对于这个前壳核区分也不是特别明确，几个主要图谱里也没有。
jucy_jucy: 请问找到方法吗
是指猴子: 想问下这个前壳核是如何让定义的，最近需要前壳核这个脑区，但是又很难找这个脑区的
阿龙先生啊: 非常不错的技术领域文章分享，解决了我在实践中的大问题！博主很有耐心，更有对知识的热忱和热爱，写了这么实用有效的分享，值得收藏点赞。
Rosy71327: “接下来，我们需要指定对比度，Import contrasts选项允许从以前的分析中得到对比度。我们首先点击这个选项，然后在弹出的界面中选择sess1/SPM8_ana路径下的SPM.mat文件，点击Done。” 您好，请问这一步我点击Import contrasts后找到sess1/SPM8_ana，但是没有文件可以选择，然后显示要打开*.mres.mat格式的文件