环状RNA翻译和常用验证方法介绍
随着环状RNA研究的不断发展,我们对环状RNA功能的认识已经从早期的“暗物质”,到前几年“miRNA海绵吸附”和转录调控,再到如今很热的蛋白编码。
环状RNA翻译功能的发现并不是横空出世的,对其研究也有一个过程或阶段。在生物信息学和NGS技术推动下,更是从外源性人工合成小环状RNA的表达研究,转变为内源性核糖体相关环状RNA(ribo-circRNA)的高通量预测和功能验证研究。
第35期OmicShare在线课堂,将与大家分享环状RNA编码的相关内容,主要从以下四个方面进行介绍:
一. 环状RNA的生物功能研究进展
图1 环状生物学功能进展
二. 真核生物翻译背景知识和相关元件介绍
图2 翻译过程简单介绍
三. 环状RNA翻译的类型
核糖体进入位点(IRES)介导的翻译
非IRES介导的翻译:
滚环扩增翻译(RCA);
由UTR或其他翻译激活原件诱导的翻译;
m6A修饰后的翻译。
图3 翻译过程简单介绍
四. 环状RNA翻译的验证方法
NGS和生物信息学:ORF预测,翻译组学等方法。
功能学:
外源性(人工合成小circRNA,荧光报告基因);
内源性(Minigene和表达载体,蔗糖密度梯度实验,质谱鉴定等)。
图4 翻译组学介绍
第35期OmicShare课堂
交流主题:
环状RNA翻译和常用验证方法介绍
交流时间:
5月25日(下周四) 下午16:00
交流嘉宾:
基迪奥产品经理-董博士
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