无障碍 关怀版

高分必备!DCA决策曲线来了!

临床生信之家目前有2种生信服务模式:

1.提供完整技术路线的设计和分析报告(包括原始数据,方法学,结果图及解读)

2.深度合作,协助完成从选题到发表的全过程,未达到协议目标,将全额退款!

扫码咨询相关分析套路的研究方法

大家知道,平台上有一个工具叫 预后模型,就是一个疾病风险预测公式,包括几个关键基因+权重,这个功能临床的同学特别喜欢。

但光构建了一个预测模型是不够的,至少发不了高分期刊。还需要说明这个预测模型好,一种方法是用一个外部数据验证,另一种方法是和已知的预测模型比较,这个时候,就要用到决策曲线,它是通过预测净受益对多个模型进行评价的一种方法。

决策曲线分析法(Decision Curve Analysis,DCA)是在2006年由纪念斯隆凯特琳癌症研究所的AndrewVickers等人发明的一种新的计算方法。我们在PubMed根据关键字"decision curve analysis"检索最近5年时间的发文量在2354篇,很多顶级期刊包括Ann Intern Med、JAMA、BMJ、J Clin Oncol等都采用这种方法。

这么高大上的分析,咋们平台必须拿捏!工具就在首页的高级预后分析里。

选择 DCA决策曲线,如下图

然后是样本选择,目前支持TCGA数据,先在样本框选择肿瘤样本,接下来就模型的输入,最多可同时对5个模型进行比较哪个模型的预测效果最佳;输入方式有两种,第一种直接输入基因,如下图

第二种方式是基因+相应的系数

两种方式的区别在于:只输入基因时,会根据Cox 比例风险回归模型(Cox Proportional Hazards Model and Extensions)对输入基因构建模型,得到每个样本的风险评分;输入基因和相对应的系数,采用“系数*基因表达”然后再求和计算每个样本的风险评分。当然以上步骤都是自动的,不用管。

最后在选上预后状态和时间点击plot后稍作等待就可得到结果啦。

结果解读很简单,黄线(ALL)和绿线(None)是两条参考线,纵坐标是benifit,所以越在上面的曲线,当然就越好了,横坐标是不同risk threshold(意义不懂可以忽略,反正就是不同样本情况下),上面的例子可以看到,红线大部分情况都是在最上面的,所以可以认为红线所对应的模型是最好的。

老规矩,图例,方法学,同样展示在图片下方;高清矢量图,原始数据,依旧是一键下载。

大家还有其他什么想法,都可以在官网的“交流区”留言,我们就可以收到啦。

为”生信0代码”而生!

临床生信之家 www.aclbi.com,收藏起来 返回搜狐,查看更多

责任编辑:

平台声明:该文观点仅代表作者本人,搜狐号系信息发布平台,搜狐仅提供信息存储空间服务。
阅读 ()

玻璃钢生产厂家贵州玻璃钢海豚雕塑四川装饰商场美陈制作通用玻璃钢雕塑摆件定制园林玻璃钢雕塑品牌重庆玻璃钢雕塑设计商濮阳玻璃钢不锈钢镂空雕塑宁波商场美陈报价延安卡通玻璃钢雕塑价格郑州小区玻璃钢雕塑价格阜阳玻璃钢雕塑供应商上海周年庆典商场美陈费用河源玻璃钢雕塑造型耒阳玻璃钢十二生肖雕塑玻璃钢网红卡通雕塑卡通玻璃钢雕塑设计及定制淄博玻璃钢海豚雕塑定制公仔玻璃钢卡通雕塑直销价格六盘水玻璃钢景观雕塑厂家商场美陈管理ppt玻璃钢雕塑怎么与树桩粘合南宁玻璃钢泡沫雕塑价格建邺秋季商场美陈大同公园玻璃钢雕塑生产厂家黄陂玻璃钢花盆花器新密佛像玻璃钢人物雕塑厂家广东室内商场美陈采购菏泽佛像校园玻璃钢景观雕塑广东常见商场美陈哪里有玻璃钢雕塑摆件施工公司浙江玻璃钢花盆有哪些香港通过《维护国家安全条例》两大学生合买彩票中奖一人不认账让美丽中国“从细节出发”19岁小伙救下5人后溺亡 多方发声单亲妈妈陷入热恋 14岁儿子报警汪小菲曝离婚始末遭遇山火的松茸之乡雅江山火三名扑火人员牺牲系谣言何赛飞追着代拍打萧美琴窜访捷克 外交部回应卫健委通报少年有偿捐血浆16次猝死手机成瘾是影响睡眠质量重要因素高校汽车撞人致3死16伤 司机系学生315晚会后胖东来又人满为患了小米汽车超级工厂正式揭幕中国拥有亿元资产的家庭达13.3万户周杰伦一审败诉网易男孩8年未见母亲被告知被遗忘许家印被限制高消费饲养员用铁锨驱打大熊猫被辞退男子被猫抓伤后确诊“猫抓病”特朗普无法缴纳4.54亿美元罚金倪萍分享减重40斤方法联合利华开始重组张家界的山上“长”满了韩国人?张立群任西安交通大学校长杨倩无缘巴黎奥运“重生之我在北大当嫡校长”黑马情侣提车了专访95后高颜值猪保姆考生莫言也上北大硕士复试名单了网友洛杉矶偶遇贾玲专家建议不必谈骨泥色变沉迷短剧的人就像掉进了杀猪盘奥巴马现身唐宁街 黑色着装引猜测七年后宇文玥被薅头发捞上岸事业单位女子向同事水杯投不明物质凯特王妃现身!外出购物视频曝光河南驻马店通报西平中学跳楼事件王树国卸任西安交大校长 师生送别恒大被罚41.75亿到底怎么缴男子被流浪猫绊倒 投喂者赔24万房客欠租失踪 房东直发愁西双版纳热带植物园回应蜉蝣大爆发钱人豪晒法院裁定实锤抄袭外国人感慨凌晨的中国很安全胖东来员工每周单休无小长假白宫:哈马斯三号人物被杀测试车高速逃费 小米:已补缴老人退休金被冒领16年 金额超20万

玻璃钢生产厂家 XML地图 TXT地图 虚拟主机 SEO 网站制作 网站优化