一种与鹅肉品质性状相关的SNP分子标记

本发明涉及基因测序领域，特别是涉及一种与鹅肉品质性状相关的snp分子标记。

背景技术：

1、鹅肉是一种营养丰富的肉类，因其高蛋白、低脂肪、低胆固醇而被认为是一种健康食品，被世界各国视为理想的肉制品之一，是肉类食品的重要来源。卫生组织.2021年，中国鹅肉产量达到了惊人的5.7亿只，占亚洲总产量的99％和全球总产量的94％。此外，中国鹅肉产量达到177万吨。四川白鹅(anser cygnoides domesticus)以其卓越的肉质而闻名，是中国独特的地方品种。它的特点是柔软细腻的质地，有助于其享有盛誉和巨大的市场价值。近年来，鹅肉市场需求稳中有升这种激增可归因于对健康生活方式的日益关注，从而突显了肉鹅行业的重大机遇。鹅的肉质是由众多基因塑造的多方面属性，包括主要影响和次要影响。管理这一特性的复杂和多方面的监管机制增加了它的复杂性。以往的研究广泛记录了品种、年龄、营养、环境和疾病等因素对鹅肉质性状的影响。因此，识别和筛选与这些性状相关的分子标记和关键基因具有巨大的潜力，可以提高育种效率，提高鹅肉的整体品质。肉质评价主要依赖于肉色的亮度(l*)、红度(a*)、黄度(b*)、ph值、剪切力(sf)、蒸煮损失率(clr)、粗度等多项肉类指标。脂肪含量(cfc)。富含蛋氨酸的饮食已被证明对胸肌肉产量产生积极影响，提高ph值，增强肉色，减少肌肉剪切。饮食中脂肪酸的存在直接影响肉的风味和肌内脂肪的产生。研究表明，饮食中较高水平的大豆磷脂会增加胸肌和腿部肌肉的脂肪含量，从而提高束缚力，减少滴水损失，并最大限度地减少肌肉中的烹饪损失。此外，粗脂肪含量(cfc)的增加会促进肌间脂肪沉积，削弱肌纤维之间的结合力。结果，剪切力降低，肉嫩度提高。

2、全基因组关联研究(gwas)调查种群表型和基因型之间的关系，在鉴定与畜禽肉质性状相关的遗传变异方面取得重要发现。全基因组重测序技术的进步使得能够准确筛查各种类型的遗传变异，包括单核苷酸多态性(snps)、插入缺失位点(indels)、结构变异位点(svs)、拷贝数变异(cnvs)、存在/缺席变异(pav)等。目前尚无利用全基因组重测序成功检测到川鹅基因组中与肉质性状相关的单核苷酸多态性(snps)。

技术实现思路

1、为解决上述技术问题，本发明提供了一种与鹅肉品质性状相关的snp分子标记，对鹅肉品质性状进行了gwas分析，并确定了43个与这些性状显着相关的snp，有助于全面了解鹅肉品质性状的遗传机制。

2、本发明解决其技术问题所采用的技术方案是：一种与鹅肉品质性状相关的snp分子标记，所述snp分子标记如下：

3、

4、

5、优选地，11个snps基因型包括如下：与b*meat yellowness相关：chr13:25432644,ctg930:11921,chr36:5611038,ctg2092:176333,chr29:8278595,chr9:33911228,chr1:24867798，chr7:16992800，

6、与sf meat相关：

7、chr12:31782870,

8、chr12:31781825,

9、chr2:36812553。

10、优选地，maldi-tof ms引物序列：

11、

12、优选地，所选鹅肉品质相关snps的频率和基因型：

13、

14、本发明的有益效果：

15、本发明对鹅肉品质性状进行了gwas分析，并确定了43个与这些性状显着相关的snp。有助于全面了解鹅肉品质性状的遗传机制，为该领域的未来研究奠定坚实的基础。

技术特征：

1.一种与鹅肉品质性状相关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记如下：

2.根据权利要求1所述的一种与鹅肉品质性状相关的snp分子标记，其特征在于：11个snps基因型包括如下：

3.根据权利要求1所述的一种与鹅肉品质性状相关的snp分子标记，其特征在于：maldi-tofms引物序列：

4.根据权利要求1所述的一种与鹅肉品质性状相关的snp分子标记，其特征在于：所选鹅肉品质相关snps的频率和基因型：

技术总结
本发明公开了一种与鹅肉品质性状相关的SNP分子标记，涉及及基因测序领域，本发明的技术方案为了筛选和鉴定与鹅肉品质性状相关的单核苷酸多态性(SNP)，对70日龄的雄性四川白鹅进行了全基因组关联分析(GWAS)筛选鹅基因组中的SNP。此外，使用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDITOPMS)方法检测与鹅肉相关的选定SNP的基因型。结果显示43个SNP与这些特征显着相关。此外，我们检测到28个注释基因作为五个肉质性状的潜在候选基因。SNPs附近1Mb范围内的基因富集分析显示蛋白质消化吸收途径以及糖脂代谢途径显着富集。本研究结果为鹅的标记辅助选择提供了新的遗传标记和候选基因，为了解鹅肉品质性状的遗传基础奠定了基础，为理解其遗传基础奠定了基础。

技术研发人员：高广亮,王启贵,黄萍,赵献芝,张克山,陈主平,罗艺,谢友慧,陈英,黄晓凤,薛佳佳,刘作兰,付文贵,许国洋,汪超,王珍
受保护的技术使用者：重庆市畜牧科学院
技术研发日：
技术公布日：2024/1/14